一、个人简历
赵涛，男，博士，教授，博士生导师。
2020年6月至今，西北农林科技大学，教授
2018.11 – 2020.4，比利时根特大学植物系统生物学研究中心，博士后
2013.9 – 2018.9，荷兰瓦赫宁根大学，博士
2010.9 – 2013.7， 西北农林科技大学，硕士
2006.9 – 2010.7， 山东农业大学，本科
二、研究方向
团队目前主要研究方向包括苹果基因组选择育种体系构建、苹果属种质资源系统发育与生物学特性研究、蔷薇科-苹果族-苹果属等进化尺度上重要性状（养分高效利用、开花授粉结实特性、品质形成等）的起源与进化研究等。团队侧重利用比较基因组、群体基因组、图泛基因组以及全基因组选择相关技术的融合利用，服务重要农艺性状解析与苹果育种，同时也致力研发高效苹果育种体系相关技术。
课题组近年来开发并完善了基因组共线性网络分析方法（SynNet）并将其应用到多基因家族溯源 (Zhao et al., 2017; Guo et al., 2025; Liu et al., 2025)、大规模基因组共线性特征比较(Zhao et al., 2019)、基于基因排列构建系统发育（Syn-MRL）(Zhao et al., 2021)、近邻基因网络特征分析（SNN）(Li et al., 2024) 等，在Nature Communications, Molecular Biology and Evolution, PNAS, New Phytologist, Plant Cell, Plant Physiology, Plant Journal, Horticultural Research, Current Opinion in Plant Biology等发表论文50余篇，相关成果获第十四届陕西青年科技奖。
热忱欢迎对科学问题兴趣浓厚、自学能力强、自我驱动、有行动力、有自信心、上进心、责任心、坚韧不拔、乐观开朗的研究生和博士后加入团队，为科学和产业发展添砖加瓦。
三、主持项目与学术兼职
国家重点研发计划-青年科学家，2023-2028，苹果重要经济性状全基因组选择技术体系构建（2023YFD1202400）；
国家自然科学基金优秀青年科学基金（海外），2022- 2024，苹果基因组学与分子育种；
国家自然科学基金青年基金，2022 -2024，苹果属野生种特有基因SMR2在干旱胁迫中的功能分析；
陕西省高层次人才引进计划（青年项目），2022 -2024；
担任Journal of Integrative Agriculture (JIA)、Horticulture Advances 编委
四、主讲课程
园艺植物基因组学，园艺科学进展（全英文），现代植物分子育种技术（全英文），科研方法与学术道德规范
五、联系方式
通讯地址：陕西杨凌邰城路3号西北农林科技大学园艺学院
Email: tao.zhao@nwafu.edu.cn
六、代表论文
Zhang Y#, Qian K#, Yu Q, Chen X, Liang J, Liu Z, Dong Z, Liu Y, Sun Y, Guo Z*, Ma F, Zhao T*. (2025). Subgenomic divergence and functional innovation following whole-genome duplication in Maleae species of Rosaceae. The Plant Journal. 123(6):e70499.（苹果族植物亚基因组分型以及结构和功能多样化解析）
Guan C#*, Liu Y#, Li Z#, Zhang Y, Liu Z, Zhu Q, Zhang P, Shen X, Fang J, Li J, Zhang Q, Guan Q, Luo Z, Yang Y, Zhao T*. (2025). Haplotype-resolved and chromosome-level reference genome assembly of Diospyros deyangensis provides insights into the evolution and juvenile growth of persimmon. Horticulture Research. 8;12(4):uhaf001.（四倍体德阳柿基因组解析）
Zhu L#, Lan J#, Zhao T, Li M*, Ruan YL*. (2025) How vacuolar sugar transporters evolve and control cellular sugar homeostasis, organ development and crop yield. Nature Plants. 2025 Jun;11(6):1102-1115 (合作综述论文)
Zhang Y#, Zhang S#, Guo W#, Zhang Y#, Chen X, Yu Q, Liu Y, Sun Y, Yu K, Li H*, Ma F*, Zhao T*. (2025). A near-gapless genome assembly of Pseudocydonia sinensis uncovers unique phenylpropanoid pathways. Plant Biotechnology Journal.23(9):3581-3596.（光皮木瓜基因组解析）
Liu, Y., Zhang, Y., Han, S., Guo, B., Liang, J., Yu, Z., Yang, F., Sun, Y., Xue, J., Lin, Z., Schranz, M.E., Guan, C.*, Ma, F.*, Zhao, T.* (2025). S-RNase evolution in self-incompatibility: phylogenomic insights into synteny with Class I T2 RNase genes. Plant Physiology, 20, kiaf072. (揭示自交不亲和关键基因S-RNase起源之谜)
Guo, B., Zhang, Y., Liu, Z., Li, X., Yu, Z., Ping, B., Sun, Y.*, van den Burg, H.A., Ma, F.*, Zhao, T.* (2025). Deciphering plant NLR genomic evolution: synteny-informed classification unveils insights into TNL gene loss. Molecular Biology and Evolution, 42(2), msaf015. （揭示大进化尺度NLR基因复杂共线性）
Li, H., Li, J., Li, X., Li, J., Chen, D., Zhang, Y., Yu, Q., Yang, F., Liu, Y., Dai, W., Sun, Y.*, Li, P., Schranz, M.E., Ma, F.*, Zhao, T.* (2024). Genomic investigation of plant secondary metabolism: insights from synteny network analysis of oxidosqualene cyclase flanking genes. New Phytologist, 245(5), 2150-2169 (SNN, 邻域基因共线性网络分析)
Yu, Z., Li, J., Wang, H., Ping, B., Li, X., Liu, Z., Guo, B., Yu, Q., Zou, Y., Sun, Y.*, Ma, F.*, Zhao, T.* (2024). Transposable elements in Rosaceae: insights into genome evolution, expression dynamics, and syntenic gene regulation. Horticulture Research, 11(6), uhae118. （蔷薇科代表植物基因组转座子活动特性）
Yang, F., Luo, J., Guo, W., Zhang, Y., Liu, Y., Yu, Z., Sun, Y.*, Li, M., Ma, F.*, Zhao, T.* (2024). Origin and early divergence of tandem duplicated sorbitol transporter genes in Rosaceae: insights from evolutionary analysis of the SOT gene family in angiosperms. The Plant Journal, 117(3), 856-872. （山梨醇转运蛋白古老串联起源与功能分化）
Zhao, T.*, Zwaenepoel, A., Xue, J. Y., Kao, S. M., Li, Z., Schranz, M. E., & Van de Peer, Y*. (2021). Whole-genome microsynteny-based phylogeny of angiosperms. Nature Communications, 12(1), 1-14. (Syn-MRL, 利用共线性特征构建系统发育，论文获北京师范大学张大勇教授Faculty Opinions推荐)
Zhao, T. and Schranz, E.* (2019). Network-based microsynteny analysis identifies major differences and genomic outliers in mammalian and angiosperm genomes. Proceedings of the National Academy of Sciences. 116(6), 2165-2174. （大规模微共线性特征分析）
Zhao, T., Holmer, R., de Bruijn, S., Angenent, G.C., van den Burg, H.A., and Schranz, M.E.* (2017). Phylogenomic synteny network analysis of MADS-box transcription factor genes reveals lineage-specific transpositions, ancient tandem duplications, and deep positional conservation. The Plant Cell 29, 1278-1292. (论文获Science杂志亮点推荐 )
Zhao, T., and Schranz, M.E.* (2017). Network approaches for plant phylogenomic synteny analysis. Current Opinion in Plant Biology 36, 129-134.
