一、个人简历
赵涛,男,博士,教授,博士生导师。
2020年6月至今,西北农林科技大学,教授
2018.11 – 2020.4,比利时根特大学植物系统生物学研究中心,博士后
2013.9 – 2018.9,荷兰瓦赫宁根大学,博士
2010.9 – 2013.7, 西北农林科技大学,硕士
2006.9 – 2010.7, 山东农业大学,本科
二、研究方向
近年来开发并完善了基因组共线性网络分析方法(SynNet)并将其应用到多基因家族溯源、大规模基因组共线性特征比较、基于基因排列构建系统发育(Syn-MRL)、近邻基因网络特征分析(SNN)等,在Nature Communications, Molecular Biology and Evolution, PNAS, New Phytologist, Plant Cell, Plant Physiology, Plant Journal, Horticultural Research, Current Opinion in Plant Biology等发表论文50余篇,多篇论文被Science, Faculty Opinions 等亮点推荐,获第十四届陕西青年科技奖。
目前团队主要研究方向包括苹果基因组选择育种体系构建;苹果属种质资源系统发育和特性研究;蔷薇科植物系统发育基因组学;利用多组学在多进化尺度上挖掘重要性状(养分高效利用、开花授粉结实特性、品质形成等)的起源与进化;利用基因编辑技术创新种质资源等。团队目前致力于比较基因组、群体基因组、泛基因组和全基因组选择育种方面相关的方法创新,以及苹果种质资源再生转化和基因编辑效率提升方面的体系构建。
热忱欢迎对科学问题兴趣浓厚、自学能力强、自我驱动、有行动力、有自信心、上进心、责任心、坚韧不拔、乐观开朗的研究生和博士后加入团队,为科学和产业发展添砖加瓦。
三、主持项目
国家重点研发计划-青年科学家,2023-2028,苹果重要经济性状全基因组选择技术体系构建(2023YFD1202400)
国家自然科学基金优秀青年科学基金(海外),2022- 2024
国家自然科学基金青年基金,2022 -2024
陕西省高层次人才引进计划(青年项目),2022 -2024
引进人才科研启动项目,2020-2025
四、主讲课程
园艺植物基因组学,园艺科学进展(全英文),现代植物分子育种技术(全英文),科研方法与学术道德规范
五、代表论文
Liu, Y., Zhang, Y., Han, S., Guo, B., Liang, J., Yu, Z., Yang, F., Sun, Y., Xue, J., Lin, Z., Schranz, M.E., Guan, C.*, Ma, F.*, Zhao, T.* (2025). S-RNase Evolution in Self-Incompatibility: Phylogenomic Insights into Synteny with Class I T2 RNase Genes. Plant Physiology, 20, kiaf072. (第一通讯作者)
Guo, B., Zhang, Y., Liu, Z., Li, X., Yu, Z., Ping, B., Sun, Y.*, van den Burg, H.A., Ma, F.*, Zhao, T.* (2025). Deciphering Plant NLR Genomic Evolution: Synteny-Informed Classification Unveils Insights into TNL Gene Loss. Molecular Biology and Evolution, 42(2), msaf015. (第一通讯作者)
Li, H., Li, J., Li, X., Li, J., Chen, D., Zhang, Y., Yu, Q., Yang, F., Liu, Y., Dai, W., Sun, Y.*, Li, P., Schranz, M.E., Ma, F.*, Zhao, T.* (2024). Genomic investigation of plant secondary metabolism: insights from synteny network analysis of oxidosqualene cyclase flanking genes. New Phytologist, 245(5), 2150-2169 (Synteny Neighborhood Network Analysis, 第一通讯作者)
Yu, Z., Li, J., Wang, H., Ping, B., Li, X., Liu, Z., Guo, B., Yu, Q., Zou, Y., Sun, Y.*, Ma, F.*, Zhao, T.* (2024). Transposable elements in Rosaceae: insights into genome evolution, expression dynamics, and syntenic gene regulation. Horticulture Research, 11(6), uhae118. (第一通讯作者)
Yang, F., Luo, J., Guo, W., Zhang, Y., Liu, Y., Yu, Z., Sun, Y.*, Li, M., Ma, F.*, Zhao, T.* (2024). Origin and early divergence of tandem duplicated sorbitol transporter genes in Rosaceae: insights from evolutionary analysis of the SOT gene family in angiosperms. The Plant Journal, 117(3), 856-872. (第一通讯作者)
Zhao, T.*, Zwaenepoel, A., Xue, J. Y., Kao, S. M., Li, Z., Schranz, M. E., & Van de Peer, Y*. (2021). Whole-genome microsynteny-based phylogeny of angiosperms. Nature Communications, 12(1), 1-14. (Syn-MRL,第一作者&第一通讯作者)
Zhao, T. and Schranz, E.* (2019). Network-based microsynteny analysis identifies major differences and genomic outliers in mammalian and angiosperm genomes. Proceedings of the National Academy of Sciences. 116(6), 2165-2174. (第一作者)
Zhao, T., Holmer, R., de Bruijn, S., Angenent, G.C., van den Burg, H.A., and Schranz, M.E.* (2017). Phylogenomic synteny network analysis of MADS-box transcription factor genes reveals lineage-specific transpositions, ancient tandem duplications, and deep positional conservation. The Plant Cell 29, 1278-1292. (第一作者)
Zhao, T., and Schranz, M.E.* (2017). Network approaches for plant phylogenomic synteny analysis. Current Opinion in Plant Biology 36, 129-134. (第一作者)
六、联系方式
通讯地址:陕西杨凌邰城路3号西北农林科技大学园艺学院
Email: tao.zhao@nwafu.edu.cn